Filippo Pinto e Vairo nasceu em Rio Branco, Acre em 1983, filho de Francisco Vairo e Fátima Isabel Pinto e Vairo. Fez Residência em Genética Médica no Hospital de Clínicas de Porto Alegre. Enquanto residente atuou em programas de pesquisa na área de erros inatos do metabolismo. Ainda na residência médica, iniciou o mestrado em Ciências Médicas, concluído em 2012, e foi a seguir admitido no programa de doutorado em Genética e Biologia Molecular, ambos da UFRGS.
Obteve seu doutorado em 2014 com pesquisa focada na doença de Gaucher. No início de 2013 foi contratado como geneticista médico no Serviço de Genética Médica no HCPA. Exerceu responsabilidades de treinamento no Programa de Residência em Genética Médica e atuou como docente colaborador em diversos cursos de pós-graduação da UFRGS. Participou de um programa inovador de informações sobre distúrbios metabólicos que atende todo o Brasil (SIEM, o Serviço de Informações sobre Erros Inatos do Metabolismo). Por meio desse programa, prestou suporte para serviços de genética médica em todo o país e liderou projetos de pesquisa financiados pelo Ministério da Saúde do Brasil na área de doenças raras. Foi, por dois anos, membro da Diretoria da Sociedade Brasileira de Genética Médica e Genômica. É Editor Assistente do Journal of Inborn Errors of Metabolism and Screening, jornal oficial da Sociedade Latino-Americana de Erros Inatos do Metabolismo e Triagem Neonatal.
É membro do corpo de professores da Latin American School of Human and Medical Genetics – ELAG, uma iniciativa internacional anual que reúne alunos e professores renomados em de genética médica. Faz parte do Comitê Organizador do Advanced Course on Diagnosis and Treatment of Metabolic Diseases, um programa de capacitação internacional na área de Erros Inatos do Metabolismo do corpo docente da Latin American Course on Lysosomal Storage Diseases (LACLSD) e é coorganizador do LACLSD FORUM. Recebeu vários prêmios durante sua estada no Brasil. Em 2013, foi listado como um dos médicos de destaque na genética médica pela revista Editorial Review; em 2014, foi eleito um dos alunos de doutorado mais produtivos do Programa de PósGraduação em Genética e Biologia Molecular da UFRGS; em 2015 recebeu o prêmio “Jovens Lideranças Médicas” da Academia Nacional de Medicina; em 2016, sua apresentação sobre perfil de transcriptoma em mulheres com Doença de Fabry ganhou a Melhor Apresentação Oral no Congresso Brasileiro de Genética; em 2018, recebeu o prêmio “Young Physician Leader” da “InterAcademy Partnership – IAP”. Foi coautor das publicações resultantes. Deixou o Brasil para fazer pós-doutorado na Mayo Clinic em 2016 e lá foi Diretor Médico do Programa Doenças Raras e Não-diagnosticadas do Centro de Medicina Individualizada. É Professor Associado de Genética Médica na Mayo Clinic School of Health Sciences. Ele agora está em um dos principais centros de conhecimento e progresso do mundo em relação a essas doenças. É Membro Correspondente da ASRM desde 2023.
